Si vous avez besoin de changer le RootDir de votre installation docker :

Dossier source : /var/lib/docker

En premier couper le service avec la commande :

systemctl stop docker

Créer le dossier :

mkdir -p /etc/systemd/system/docker.service.d

Puis le fichier :

[Service]
ExecStart=
ExecStart=/usr/bin/dockerd -H fd:// --data-root="VOTRE_REPERTOIRE"

Puis on recharge le daemon :

systemctl daemon-reload

Puis on redémarre le service :

systemctl restart docker

Vous pouvez vérifier la nouvelle configuration :

docker info